Стручна служба Заштитника грађана, којом руководи генерални секретар надлежна је за стручне и административне послове. Почела је са радом 24. децембра 2007. године, На дан 16. 05. 2008. године у Стручној служби Заштитника грађана запослено је на неодређено време 20 државних службеника са високом стручном спремом и 2 државна службеника са средњом стручном спремом док је 5 држаних службеника са високом стручном спремом и 3 са средњом (што чини укупно 30 запослених) запослено на одређено време. На дан 31. децембар 2007. године у Стручној служби је било запослено 60% жена и 40% мушкараца. У структури запослених заступљена је мултиетничност.

Запослени у Стручној служби Заштитника грађана сваког радног дана примају грађане од 10 до 14 часова. Упркос бројности притужби и недовољним капацитетима за рад Стручне службе, ни један грађанин није враћен због доласка у другом периоду радног времена (од 9 до 17 часова).